| 机构名称 | 成立时间 | 负责人 | 依托院系（学科） | 级别 |
| 食品科学与技术国家重点实验室 | 2007.10.26 | 谢明勇 | 江南大学、南昌大学 | 国家级平台 |
| 国家硅基LED工程技术研究中心 | 2011.1.7 | 江风益 | 材料科学与工程学院 | 国家级平台 |
| 食品科学教育部重点实验室 | 2002 | 谢明勇 | 生命科学与食品工程学院 | 部级平台 |
| 鄱阳湖环境与资源利用教育部重点实验室 | 2007.11.1 | 黄云 | 环境与化学工程学院 | 部级平台 |
| 发光材料与器件教育部工程研究中心 | 2001 | 江风益 | 材料科学与工程学院 | 部级平台 |
| 生物质转化教育部工程研究中心 | 2006.6.27 | 生命科学与食品工程学院 | 部级平台 | |
| 江西省食品生物技术重点实验室 | 2000 | 陈红兵 | 中德联合研究院 | 省级平台 |
| 江西省发光材料重点实验室 | 2000 | 张萌 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省分子医学重点实验室 | 2001.11 | 戴育成 | 第二附属医院 | 省级平台 |
| 江西省机器人与焊接自动化重点实验室 | 2002 | 张华 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省鄱阳湖综合治理与资源开发重点实验室 | 2003 | 黄云 | 南昌大学、江西师范大学、省山江湖办 | 省级平台 |
| 江西省分子生物学与基因工程重点实验室 | 2005.3 | 朱友林 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省消化病研究重点实验室 | 2005.3 | 吕农华 | 第一附属医院 | 省级平台 |
| 江西省神经科学重点实验室 | 2010.9.27 | 李葆明 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省地球空间信息重点实验室 | 2010.9.27 | 邓晓华 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省植物资源重点实验室、江西省庐山植物园 | 2010.9.27 | 杨柏云 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省医学生物高技术重点实验室 | 2001 | 李文林 | 江西省医学科学研究院 | 省级平台 |
| 江西省制造业信息化工程技术研究中心 | 2002 | 辛勇 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省生物质转化工程技术研究中心 | 2004.1 | 南昌大学 | 省级平台 | |
| 江西省汽车电子工程技术研究中心 | 2007.12.21 | 黄菊花 | 南昌大学、江铃汽车集团公司 | 省级平台 |
| 江西省心脏血管疾病工程技术研究中心 | 2009.12 | 程小曙 | 第二附属医院 | 省级平台 |
| 江西省嵌入式系统工程技术研究中心 | 2009.11 | 李立宏 | 南昌大学、中兴长天信息技术有限公司、中兴软件技术有限公司 | 省级平台 |
| 江西省半导体发光材料工程技术研究中心 | 2000 | 江风益 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省转化医学工程技术研究中心 | 2010.9.27 | 辛洪波 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省新能源化学重点实验室 | 2011.9.30 | 陈义旺 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省高性能精确凝固成形重点实验室 | 2011.9.30 | 杨湘杰 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省临床药物代谢动力学重点实验室 | 2011.9.30 | 熊玉卿 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省心血管系统重点实验室 | 2011.9.30 | 洪葵 | 第二附属医院 | 省级平台 |
| 江西省再生医学工程技术研究中心 | 2011.9.30 | 王共先 | 第一附属医院 | 省级平台 |
| 江西省呼吸病重点实验室 | 2011.11.23 | 张伟 | 第一附属医院 | 省级平台 |
| 江西省微尺度交叉科学重点实验室 | 2012.8.20 | 郑泉水 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省基础药理学重点实验室 | 2012.8.20 | 何明 | 南昌大学 | 省级平台 |
| 江西省智能信息系统重点实验室 | 2012.8.20 | 南昌大学 | 省级平台 | |
| 江西省创面修复工程技术研究中心 | 2012.8.20 | 郭光华 | 第一附属医院 | 省级平台 |
| 江西省肝胆疾病工程技术研究中心 | 2012.8.20 | 邵江华 | 第二附属医院 | 省级平台 |
| 江西省眼科学与视觉科学研究所 | 2012 | 易敬林 | 附属眼科医院 | 省级平台 |
| 江西省血液学重点实验室 | 2013 | 第二附属医院 | 省级平台 | |
| 江西省人工关节工程技术研究中心 | 2013 | 第一附属医院 | 省级平台 | |
| 江西省眼科学重点实验室 | 2013 | 易敬林 | 附属眼科医院 | 省级平台 |
| 江西省高等学校高分子及应用催化重点实验室 | 2005 | 陈义旺 | 材料科学与工程学院 | 厅级平台 |
| 江西省高等学校现代机械设计工程技术研究中心 | 2005 | 刘莹 | 机电工程学院 | 厅级平台 |
| 江西省高等学校微纳米科学与技术重点实验室 | 2008.8.7 | 王立 | 高等研究院 | 厅级平台 |
| 江西省高等学校太阳能光伏技术工程技术研究中心 | 2008 | 周浪 | 南昌大学光伏研究院 | 厅级平台 |
| 江西省高等学校功能杂化高分子重点实验室 | 2009.9.1 | 陈义旺 | 理学院 | 厅级平台 |
| 江西省高等学校基础医学重点实验室 | 梁尚栋 | 医学部 | 厅级平台 | |
| 中德联合研究院 | 1988 | 陈红兵 | 南昌大学 | 校级独立机构 |
| 南昌大学材料科学研究所 | 1994 | 王立 | 材料科学与工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学稀土与微纳功能材料研究中心 | 1995 | 李永绣 | 理学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学应用化学研究所 | 1994 | 张宁 | 理学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学近代物理研究所 | 1996 | 刘正东 | 理学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学中德食品工程中心 | 2001 | 刘成梅 | 生命科学与食品工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学机械电子研究所 | 1993 | 张华 | 机电工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学计算机技术工程研究所 | 1994 | 罗建平 | 信息工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学鄱阳湖研究中心 | 2003 | 黄云 | 环境与化学工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学设计研究院 | 1963 | 贾益纲 | 建筑工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学军工研究院 | 2006.8.9 | 刘卫东 | 机电工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学高等研究院 | 2007.1.13 | 郑泉水 | 南昌大学 | 校级独立机构 |
| 南昌大学LDK太阳能研究中心 | 2007.2.14 | 周浪 | 材料科学与工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学芯片设计研究中心 | 2007.9.12 | 理学院 | 校级独立机构 | |
| 南昌大学物联网与智能计算研究中心 | 2007.9.12 | 李建民 | 信息工程学院、软件学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学铁道装备工程研究中心 | 2009.3.21 | 陶捷 | 机电工程学院，信息工程学院，建工学院，环境与化学工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学转化医学研究院 | 2010.2.8 | 辛洪波 | 医学部、生命科学与食品工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学生命科学研究院 | 2010.2.8 | 李葆明 | 生命科学与食品工程学院、医学部 | 校级独立机构 |
| 南昌大学空间科学与技术研究院d> | 2010.2.8 | 邓晓华 | 信息工程学院、机电工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学锂电及新能源汽车研究院 | 2011.5.8 | 杨湘杰 | 机电工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学信息科学与技术研究院 | 2012.11.20 | 信息工程学院 | 校级独立机构 | |
| 南昌大学绿色建筑技术研究院 | 2012.12.18 | 姜漪 | 建筑工程学院 | 校级独立机构 |
| 南昌大学免疫与生物治疗研究所 | 2013.3.16 | 江西省医学科学研究院 | 校级独立机构 | |
| 南昌大学光伏研究院 | 2014 | 周浪 | 材料科学与工程学院 | 校级独立机构 |
| 人类衰老研究所 | 2015.09 | 田小利 | 生命科学学院 | 校级独立机构 |
| 江西省人类衰老重点实验室 | 2018.09 | 田小利 | 生命科学学院 | 省级科研平台（省重点实验室） |